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搜索关键字:生物信息学    ( 81个结果
医学信息学
生物医学大数据: 参考书: 信息学是研究数据生命周期的学科,所以生物信息学是研究生物数据生命周期的学科。 Data-information-knowledge-wisdom 37-37℃--fever--prediction or deal with (medicine) Descriptive|p ...
分类:其他好文   时间:2019-10-24 18:19:34    阅读次数:96
Contig|scaffold|N50|L50|NG50|贪心算法|de bruiji graph|
生物信息学 Contig是reads拼成的连续的DNA片段,连续表达一个gene。通过双端测序的contig可确定contig之间的关系得到scaffold,Scaffold是reads拼成的有gap的DNA片段。理想情况下,一条染色体用同一个scaffold的表达。整个genome存在很多零碎片段 ...
分类:编程语言   时间:2019-10-23 13:22:54    阅读次数:106
02-04 线性回归
[TOC]更新、更全的《机器学习》的更新网站,更有python、go、数据结构与算法、爬虫、人工智能教学等着你:https://www.cnblogs.com/nickchen121/# 线性回归线性回归是比较经典的线性模型,属于监督学习中预测值为连续值的回归问题。线性回归针对的是一个或多个特征与连... ...
分类:其他好文   时间:2019-10-16 17:47:05    阅读次数:82
生物网络,RNA 与疾病关联分析
题目: 大数据时代下基于网络算法和机器学习的非编码RNA 相关预测研究摘要:最近越来越多的生物实验表明非编码RNA 具有非常重要的生物学功能,参与细胞中的多项重要生命活动,调控许多基本且重要的生物过程。通过这些调控过程,非编码RNA 与人类疾病密切相关。深入研究非编码RNA 的生物功能与调控机制,进 ...
分类:其他好文   时间:2019-10-12 11:11:22    阅读次数:61
basecalling|vector mark|Assembly的难题|
生物信息学 染色体可以据染色图谱判断染色体号码,1-22号染色体依次变短,它们影响机体发育,23号染色体决定性别。肿瘤是由于遗传密码变异造成的。因此,遗传密码的解读非常重要,但是因为遗传密码长度非常长,所以虽然已经全部测出来,但是破译它们依然存在很多难题。 生物信息学是一个学科领域,它的研究对象基因 ...
分类:其他好文   时间:2019-09-18 23:21:22    阅读次数:113
序列比对
最常用的产生多重对齐的算法是从渐进对齐方法中派生出来的。这是Fitch和Yasunobu(1975)提出的,Hogeweg和Hesper(1984)将其应用于5S核糖体的比对RNA序列。该方法由 Da-Fei Feng and Russell Doolittle 推广。它被称为“渐进”,因为该策略需 ...
分类:其他好文   时间:2019-09-12 18:15:19    阅读次数:207
一次数据库|二次数据库|
生物医学大数据-组学数据资源 困境: 经过human genome project之后得到了Book of life,但是测得base仅仅是生物信息学分析的开始,因为发现了数据的几个重要特点。首先是数据量过大,虽然科学家想通过不同组学角度(组学也随着数据量的增多层层细化和深入)来简化和系统解读过程, ...
分类:数据库   时间:2019-09-05 18:57:20    阅读次数:298
Python——assert、isinstance的用法
1.assert 函数说明: 使用范例 D:\Users\lenovo\Anaconda3\python.exe F:/机器学习/生物信息学/Code/NumPy.py Traceback (most recent call last): File "F:/机器学习/生物信息学/Code/NumPy ...
分类:编程语言   时间:2019-07-11 14:07:17    阅读次数:128
用Python实现一个爬虫爬取ZINC网站进行生物信息学数据分析
最近接到实验室的导师交给我的一个任务,就是他们手头有很多smile表达式,格式类似这种:C(=C(c1ccccc1)c1ccccc1)c1ccccc1(这是生物信息学中表达小分子结构的一种常用表达式),他们需要对每个smile表达式在ZINC网站(生物信息学数据网站)上进行搜索,然后找到对应的ZIN ...
分类:编程语言   时间:2019-06-02 12:59:06    阅读次数:147
关于Python
我是生物信息学学生,关于编程语言也学了几种,总觉得不太好用,听他们说Python的话还好点,并且也是现在比较热门的,所以非常感兴趣选了肖老师的Python(班里的同学上学期修过,非常非常推荐)。我希望在老师的课堂上感受到的是学会编程的乐趣,而并不是为了解决各种事情去学习,所以无论涉及到哪一方面对于我 ...
分类:编程语言   时间:2019-03-11 13:11:33    阅读次数:116
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