Anaconda 是一个用于科学计算的Python发行版,支持Linux、Mac和Windows系统,提供了包管理和环境管理的功能,便于解决多版本Python并存、切换以及各种第三方包安装问题。 Anaconda利用工具/命令conda来进行package和environment的管理,并且已经包含 ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-10 09:11:57
阅读次数:
108
安装完anaconda后,想在mac下安装pytorch,但是在用官网提供的安装方法一直安装不上pytorch和torchvision,估计是被墙了 所以我用到清华的镜像站找到了pytorch和torchvision相应的版本并下载下来 我下载了mac版本的pytorch-1.3.1-py3.7_0 ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-10 00:48:03
阅读次数:
282
偶然看到一个比较好用的工具Trash-Cli。一个类似垃圾桶的机制,可以恢复文件。试了一下,感觉还行 (1)下载安装: https://github.com/andreafrancia/trash-cli (2)使用方法: ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-07 18:11:52
阅读次数:
126
Pysam可用来处理bam文件 安装: 用 pip 或者 conda即可 使用: Pysam的函数有很多,主要的读取函数有: AlignmentFile:读取BAM/CRAM/SAM文件 VariantFile:读取变异数据(VCF或者BCF) TabixFile:读取由tabix索引的文件; Fa ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-05 17:14:17
阅读次数:
342
为了让jupyterhub 开机启动,或者以服务的方式启动,折腾了好久。环境 ubuntu 16.04anaconda >= 4.5python35 jupyterhub 0.9.4node 6.14.4背景jupyterhub 安装在 conda的虚拟环境中 只有进入该虚拟环境中才能执行jupyt ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-03 23:46:12
阅读次数:
127
一、环境准备 ①准备三台虚拟机,配置静态IP ②先修改主机名(每个节点统一命名规范) vim /etc/hostname master #重启生效 配置DNS每个节点 vim /etc/hosts 192.168.60.121 master192.168.60.122 salve1 192.168. ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-03 18:08:46
阅读次数:
106
出现问题:Anaconda中已经用【conda install libtiff】命令安装了libtiff,并且利用命令【conda list】发现libtiff确实存在,但在pip中却不存在【pip list】 解决办法: 1. 下载anaconda中当前虚拟环境下对应版本的libtiff的whl文 ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-01 22:50:01
阅读次数:
468
在右键菜单中添加用Jupyter Notebook打开 为了把 Jupyter 的工作目录指定到某一个文件夹下,每次都要启动 CMD 终端, 然后激活 Anaconda 环境,再启动 Jupyter Notebook ,麻烦至极。 所以做了下面这个脚本,把启动 Jupyter 添加到右键菜单中,这样 ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-01 20:44:59
阅读次数:
281
CentOS7服务器配置 1.更换yum软件源 下载阿里源 更改阿里yum源为默认源 Centos 7.repo可能要看具体服务器的文件名 更新本地yum缓存 2.安装Anaconda3 "清华镜像源" 下载 2.1更换conda源 2.2更换pip源 https://blog.csdn.net/d ...
分类:
其他好文 时间:
2019-12-01 00:14:18
阅读次数:
84
一、基础知识 1、安装 conda install numpy 2、什么是numpy?Python中做科学计算的基础库,重在数值计算 二、创建数组 import numpy as np # 方式一 np.array([1, 2, 3, 4, 5]) # 方式二 np.array(range(5)) ...
分类:
其他好文 时间:
2019-11-28 18:58:05
阅读次数:
64