20世纪中期，随着蛋白质空间结构的解析和DNA双螺旋的发现，形成了以遗传信息载体核酸和生命功能执行者蛋白质为主要研究对象的分子生物学时代。分子生物学的诞生使传统的生物学研究转变为现代实验科学。但是，在生命科学领域的实验科学与其它实验科学如实验物理学相比，更多地是注重经验，而非抽象的理论或概念。此外， ...
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2016-11-02 23:28:27
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遗传算法的灵感来源于自然界和进化论，进化和遗传是我们体会到的最好的具有普遍用途的机器学习算法。本文描述了整个算法的结构并用javascript实现了一个有趣的应用。 ...
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2016-11-02 14:38:28
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我们来看一个很简单的小问题f=x1+x2+x3+x4,x1、x2、x3、x4是大于等于10小于等于100的实数，求f的最大值。 这个小学生就能解决的问题我今天打算用遗传算法来解决，你可能说这不是智障吗？但是其实这只是一个小例子，因为用同样的方法，你可以解决f=x1^x2*x3^x4/x2^x1*x4 ...
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2016-10-30 13:33:16
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略懂生物的人都知道，决定一株植物生长形态和状况的因素有两点，一是遗传基因，二是环境刺激。 既然第一点是看天和父母吃饭，只有在第二点上下功夫。 这里的第二点对植物和人来说都是环境，要是想要在人身上再具体一些的话 就变成我们常说的圈子和平台，前者指生活里和什么样的人相处，后者指学习工作中和什么样的人共事 ...
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2016-10-27 01:38:36
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MAGENTA是一款计算工具，利用全基因组遗传数据，计算预先设定的涉及生物过程或者功能性基因集在遗传相关性的富集程度。开发的目的是分析基因型不是现成的数据集，比如大型的全基因组关联荟萃分析。在以下两种情况下可以使用：1，检验某个特定的假设；2，通过检测一系列已知的生物基因集（从不同的公共数据库提供的 ...
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2016-10-23 17:52:42
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GCTA(全基因组复杂性状分析)工具开发目的是针对复杂性状的全基因组关联分析，评估SNP解释的表型方差所占的比例(该网站地址：http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可实现以下功能： 1 评估全基因组SNP的亲缘关系（遗传关系） 2 评估全基因组 ...
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2016-10-22 00:17:22
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第7章 优化：密码破译 优化简介：最优点（optimum），优化（optimization） 本章研究的问题：构建一个简单的密码破译系统，把解密一串密文当做一个优化问题。 优化方法：网格搜索（grid search），主要问题是1、步长的选择；2、维度灾难（Curse of Dimensionali ...
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2016-10-21 21:58:49
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第一章 生命的基本单位--细胞 1、生物体具有共同的物质基础和结构基础。 2、细胞是生物体的结构和功能的基本单位；细胞是一切动植物结构的基本单位。病毒没有细胞结构。 3、新陈代谢是生物体进行一切生命活动的基础。 4、生物体具应激性，因而能适应周围环境。 5、生物遗传和变异的特征，使各物种既能基本上保 ...
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2016-10-15 02:44:53
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clc clear %参数 a = 0 ; b = 4 ; eps = 0.01 ; lenchrom = ceil(log2((b - a)/eps + 1)) ; sizepop = 50 ; maxgen = 500 ; pcross = 0.9 ; pm = 0.05 ; fitness = ...
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2016-10-11 21:00:52
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今天粗略学习了遗传算法，对于基因采用二进制表示、染色体采用一串二进制数表示（如11000100）还是比较容易理解的。但是，在TSP问题（旅行商问题，travelingsalesman problem）中，需要通过遗传算法求解较优的旅行路径，如何对基因和染色体进行建模？比较合理的思路是采用城市排列作为 ...
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2016-10-07 18:01:05
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