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PSSM特征-从生成到处理
以下代码均为个人原创,如有疑问,欢迎交流。新浪微博:拾毅者本节内容: pssm生成 pssm简化 标准的pssm构建 滑动pssm生成 在基于蛋白质序列的相关预测中,使用PSSM打分矩阵会得将预测效果大大提高,同时,如果使用滑动的PSSM,效果又会进一步提高。这里主要以分享代码为主,下面介绍下PSSM从生成到处理的全过程。1.PSSM的生成PSSM的生成有多种方式,这里使用的psiblast软件,n...
分类:其他好文   时间:2015-07-08 09:37:57    阅读次数:176
python序列切片
Python中的序列包括字符串、列表、元组,下面以字符串为例进行演示,列表和元组效果同字符串>>>a=‘0123456789‘ >>>a[0:2] ‘01‘ >>>a[3:5] ‘34‘ >>>a[-2] ‘8‘ >>>a[0:] ‘0123456789‘ >>>a[2:] ‘23456789‘ >>>a[..
分类:编程语言   时间:2015-07-08 00:43:31    阅读次数:135
数组分割问题(转)
题记:这道题和《编程之美》一书中2.18节的数组分割区别不大,但本人觉得《编程之美》这一节讲的不够透彻,不好理解(或许本人愚钝),故给出自己的思路,同时也给出打印其中一种方案的方法(这一点《编程之美》并没有提到)。两个序列大小均为n,序列元素的值为任一整数,无序;要求通过交换两个序列的元素,使序列a...
分类:编程语言   时间:2015-07-08 00:26:04    阅读次数:157
计算数组的最大子序列之和
问题描述: 计算一个给定数组的最大子序列之和 分析: 有三种方法: 1,扫描3遍,可以计算所有的子序列之和,但是复杂度为N^3。 2,扫描2遍,计算以任意元素开始的和,如果大于当前的最大值则将最大值付给它,复杂...
分类:编程语言   时间:2015-07-07 23:04:23    阅读次数:446
【线段树】bzoj1756 Vijos1083 小白逛公园
我们知道,求一段序列的最大子段和是O(n)的,但是这样是显然会超时的。我们需要一个数据结构来支持修改和计算的操作,对于这种修改一个而查询区间的问题,考虑使用线段树。在线段树中,除了左端点,右端点,左儿子指针,右儿子指针之外,新开4个域——max,maxl,maxr,sum,其中sum为该区间的和,m...
分类:其他好文   时间:2015-07-07 22:40:14    阅读次数:799
2015.7.6 第一课 课程重点
1、html(超文本标记语言)结构: 标题 主体 2、换行:3、段落:4、标题:5、列表: 有序列表: 无序列表: 6、表格: 7...
分类:其他好文   时间:2015-07-07 22:32:19    阅读次数:173
关于NTFS For Mac序列号的问题
当我们下载了NTFS?For?Mac软件之后,会立马想到这款软件怎么注册,如果不注册会受到各种使用的限制,当我们注册一款软件的时候序列号是必不可少的。那么只有一个序列号能注册NTFS?For?Mac吗? 小编为了帮助大...
分类:Web程序   时间:2015-07-07 19:56:21    阅读次数:227
MongoDB中对象反序列化的一个小问题
今天在mongoDB存取对象数据的时候,碰到一个小问题:对象的某一个字段类型是抽象类或者接口,在存入的时候没有问题,但是在读取的时候,由于没有具体类的信息,无法完成对象的重新构建,就会报错: Can not construct instance of com.bp.samples.json.generics.xxx, problem: abstract types either need to...
分类:数据库   时间:2015-07-07 19:40:06    阅读次数:265
Json随笔
1、Json反序列化为对象,再通过where条件查询集合中的某条信息 反序列化需引用LitJson.dll List List_City = JsonMapper.ToObject>(city_json_info); var list = List_C...
分类:Web程序   时间:2015-07-07 19:16:19    阅读次数:170
printf在终端输出时改变颜色
在调试程序时,有时候要输出大量数据,如果让printf/fprintf改变输出数据的颜色,那观察数据就方便多了。终端的字符颜色是用转义序列控制的,是文本模式下的系统显示功能,和具体的语言无关。转义序列是以 ESC 开头,可以用 \033 完成相同的工作(ESC 的 ASCII 码用十进制表示就是 2...
分类:其他好文   时间:2015-07-07 19:14:08    阅读次数:119
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