以下代码均为个人原创,如有疑问,欢迎交流。新浪微博:拾毅者本节内容:
pssm生成
pssm简化
标准的pssm构建
滑动pssm生成
在基于蛋白质序列的相关预测中,使用PSSM打分矩阵会得将预测效果大大提高,同时,如果使用滑动的PSSM,效果又会进一步提高。这里主要以分享代码为主,下面介绍下PSSM从生成到处理的全过程。1.PSSM的生成PSSM的生成有多种方式,这里使用的psiblast软件,n...
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其他好文 时间:
2015-07-08 09:37:57
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176
Python中的序列包括字符串、列表、元组,下面以字符串为例进行演示,列表和元组效果同字符串>>>a=‘0123456789‘
>>>a[0:2]
‘01‘
>>>a[3:5]
‘34‘
>>>a[-2]
‘8‘
>>>a[0:]
‘0123456789‘
>>>a[2:]
‘23456789‘
>>>a[..
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编程语言 时间:
2015-07-08 00:43:31
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135
题记:这道题和《编程之美》一书中2.18节的数组分割区别不大,但本人觉得《编程之美》这一节讲的不够透彻,不好理解(或许本人愚钝),故给出自己的思路,同时也给出打印其中一种方案的方法(这一点《编程之美》并没有提到)。两个序列大小均为n,序列元素的值为任一整数,无序;要求通过交换两个序列的元素,使序列a...
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编程语言 时间:
2015-07-08 00:26:04
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157
问题描述: 计算一个给定数组的最大子序列之和 分析: 有三种方法: 1,扫描3遍,可以计算所有的子序列之和,但是复杂度为N^3。 2,扫描2遍,计算以任意元素开始的和,如果大于当前的最大值则将最大值付给它,复杂...
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编程语言 时间:
2015-07-07 23:04:23
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446
我们知道,求一段序列的最大子段和是O(n)的,但是这样是显然会超时的。我们需要一个数据结构来支持修改和计算的操作,对于这种修改一个而查询区间的问题,考虑使用线段树。在线段树中,除了左端点,右端点,左儿子指针,右儿子指针之外,新开4个域——max,maxl,maxr,sum,其中sum为该区间的和,m...
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其他好文 时间:
2015-07-07 22:40:14
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799
1、html(超文本标记语言)结构: 标题 主体 2、换行:3、段落:4、标题:5、列表: 有序列表: 无序列表: 6、表格: 7...
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其他好文 时间:
2015-07-07 22:32:19
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173
当我们下载了NTFS?For?Mac软件之后,会立马想到这款软件怎么注册,如果不注册会受到各种使用的限制,当我们注册一款软件的时候序列号是必不可少的。那么只有一个序列号能注册NTFS?For?Mac吗? 小编为了帮助大...
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Web程序 时间:
2015-07-07 19:56:21
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227
今天在mongoDB存取对象数据的时候,碰到一个小问题:对象的某一个字段类型是抽象类或者接口,在存入的时候没有问题,但是在读取的时候,由于没有具体类的信息,无法完成对象的重新构建,就会报错:
Can not construct instance of com.bp.samples.json.generics.xxx,
problem: abstract types either need to...
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数据库 时间:
2015-07-07 19:40:06
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265
1、Json反序列化为对象,再通过where条件查询集合中的某条信息 反序列化需引用LitJson.dll List List_City = JsonMapper.ToObject>(city_json_info); var list = List_C...
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Web程序 时间:
2015-07-07 19:16:19
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170
在调试程序时,有时候要输出大量数据,如果让printf/fprintf改变输出数据的颜色,那观察数据就方便多了。终端的字符颜色是用转义序列控制的,是文本模式下的系统显示功能,和具体的语言无关。转义序列是以 ESC 开头,可以用 \033 完成相同的工作(ESC 的 ASCII 码用十进制表示就是 2...
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其他好文 时间:
2015-07-07 19:14:08
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119