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poj2778 DNA Sequence【AC自动机】【矩阵快速幂】
DNA Sequence Time Limit: 1000MS Memory Limit: 65536K Total Submissions: 19991 Accepted: 7603 Description It's well known that DNA Sequence is a sequen ...
分类:其他好文   时间:2018-11-03 11:22:16    阅读次数:194
【序列模型】第一课--循环序列模型
一. why sequence models? (1)序列模型广泛应用于语音识别,音乐生成,情感分析,DNA序列分析,机器翻译,视频行为识别,命名实体识别等众多领域。 (2)上面那些问题可以看成使用(x,y)作为训练集的监督学习,但是输入与输出的对应关系有非常多的组合, 比如一对一,多对多,一对多, ...
分类:其他好文   时间:2018-11-02 23:52:18    阅读次数:250
TypeScript 函数
TypeScript 函数 函数类型 为函数定义类型 使用这种方式,为函数定义返回的类型 书写函数类型 书写函数类型,代表形参为baseValue和increment两个都为number类型,返回的也同样为number类型。 推断类型 会自动推断出类型 可选参数 默认参数 不能传递null和unde ...
分类:其他好文   时间:2018-10-31 01:10:04    阅读次数:149
PCR技术
qRT-PCR是指先由RNA进行反转录生成cDNA,然后以cDNA为模板进行检测,检测的是该cDNA的含量,而cDNA由特定的RNA逆转录而来,所以间接地检测了RNA的含量。 基因表达: 转录:DNA到RNA 翻译:RNA到氨基酸、蛋白 一般认为RNA, mRNA的量和最后的蛋白量一致「不考虑转录后 ...
分类:其他好文   时间:2018-10-30 23:51:30    阅读次数:219
18.10.29 POJ 3691 DNA repair(AC自动机+dp)
描述 Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA ...
分类:其他好文   时间:2018-10-30 00:28:29    阅读次数:136
NGS中的一些软件功能介绍
1.bowtie 短序列比对工具,blast也是短序列比对工具,速度快,结果易理解。 输入可以是fastq或者fasta文件。 生成比对结果文件sam格式的吧。 2.bwa 转自:https://www.jianshu.com/p/1552cc6ac3be 将DNA序列比对到参考基因组上的软件,包含 ...
分类:其他好文   时间:2018-10-27 00:06:21    阅读次数:843
第一章
1.1 生命之树 1、生物学家的梦想 一句话:构建生命之树。 2、方法与途径 最理想的途径是通过化石证据,然而化石之零散和不完整,因此大多数研究者转为比较形态学和比较生理学。通过这两个途径,基本可以得出有机体进化历史的主题框架。但是,形态及生理性状进化之复杂,不可能产生一副清晰的图像。 相比比较形态 ...
分类:其他好文   时间:2018-10-25 22:42:40    阅读次数:175
10.23js
1||2 5&&4 !0 || 遇到第一个为true的数字就终止并返回 && 遇到第一个为false的值 就终止 返回false的值,如果没有false就返回最后那个数 ||和&&在一起 &&的优先级比较高 高于|| 1.Js代码如何执行 2.js环境 3.栈 堆 Js代码在客户端执行前,浏览器会给 ...
分类:Web程序   时间:2018-10-23 23:15:11    阅读次数:275
ASP.NET Core 如何设置发布环境
在ASP.NET Core中自带了一些内置对象,可以读取到当前程序处于什么样的环境当中,比如在ASP.NET Core的Startup类的Configure方法中,我们就会看到这么一段代码: 其中env.IsDevelopment()就可以读出当前程序是否是处于开发环境当中,如果你在Visual S ...
分类:Web程序   时间:2018-10-22 01:18:53    阅读次数:2635
ngs中reads mapping-pku的生信课程
4.NGS中的reads mapping 顾名思义,就是将测序的得到的DNA定位在基因组上。 因为二代测序的得到的序列是较短的,reads mapping很好地解决了这个问题。 本质上reads mapping是一个双序列比对问题,但和之前讲的NW和SW的不一样,后者适用于两者长度相差不大的。 现在 ...
分类:移动开发   时间:2018-10-20 11:44:13    阅读次数:444
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