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搜索关键字:fastq fasta uniq 去重复 序列    ( 43198个结果
python 学习笔记 二 序列, 列表, 元组, 字符串
序列序类是一个集合概念, Pthon包括六种内建序列: 列表, 元组, 字符串, Unicode字符串, buffer对象和xrange对象. 其中, 我们最长用的要数前三个.通用序列操作 1. 索引(indexing)序列的所有元素都是有编号的(从0开始...), 这些元素可以通过编号访问, 如....
分类:编程语言   时间:2014-05-23 07:19:41    阅读次数:347
基于ARMA模型的ECG聚类算法研究
摘要: 对心电信号( ECG) 这种高维的时间序列进行聚类,最重要的方面之一即进行特征提取!本研究提出利用自回归和移动平均( ARMA)模型拟合?ZK 信号,以拟合系数的欧氏距离为结构不相似测度征进行聚类!但此方法没有考虑样本数据的各维特征对聚类的不同贡献率,所以本文提出可以把首次聚类每维特征在聚类...
分类:其他好文   时间:2014-05-23 05:45:57    阅读次数:196
最长公共子序列(LCS)
时限:1000ms内存限制:200000K 总时限:3000ms描述一个给定序列的子序列是在该序列中删去若干元素后得到的序列。确切地说,若给定序列X=,则另一序列Z=是X的子序列是指存在一个严格递增的下标序列 ,使得对于所有j=1,2,…,k有:Xij = Zj如果一个序列S即是A的子序列又是B的子...
分类:其他好文   时间:2014-05-23 05:07:19    阅读次数:283
线性表
1、抽象数据类型线性表是一种线性结构,由n(n >= 0)个类型相同的数据元素a0,..., an-1组成的有限序列。记为:LinearList = (a0, a1,..., an-1)其中n为线性表元素的个数,称为线性表长度。如果n = 0,LinearList为空表;如果n > 0, ai(0 ...
分类:其他好文   时间:2014-05-23 03:55:48    阅读次数:362
java之冒泡排序
//冒泡排序(Bubble Sorting)的基本思想是:通过对待排序序列从后向前(从下标较大的元素开始),依次比较相邻元素的排序码,若发现逆序则交换,使排序码较小的元素逐渐从后部移向前部(从下标较大的单元移向下标较小的单元),就象水底下的气泡一样逐渐向上冒。public static void m...
分类:编程语言   时间:2014-05-23 03:41:33    阅读次数:198
LDA(主题模型算法)
LDA整体流程先定义一些字母的含义:文档集合D,topic集合TD中每个文档d看作一个单词序列,wi表示第i个单词,设d有n个单词。(LDA里面称之为word bag,实际上每个单词的出现位置对LDA算法无影响)D中涉及的所有不同单词组成一个大集合VOCABULARY(简称VOC)LDA以文档集合D...
分类:其他好文   时间:2014-05-23 03:28:59    阅读次数:562
ZMQ和MessagePack的简单使用(转)
近段日子在做一个比较复杂的项目,其中用到了开源软件ZMQ和MessagePack。ZMQ对底层网络通信进行了封装,是一个消息处理队列库, 使用起来非常方便。MessagePack是一个基于二进制的对象序列化类库,具有跨语言的特性,同样非常容易使用。在我做的项目中,消息类通过 MessagePack进...
分类:其他好文   时间:2014-05-21 18:31:47    阅读次数:296
计数排序
计数排序的基本思想是:统计一个数序列中小于某个元素a的个数为n,则直接把该元素a放到第n+1个位置上。当然当过有几个元素相同时要做适当的调整,因为不能把所有的元素放到同一个位置上。计数排序假设输入的元素都是0到k之间的整数 1 #include 2 void sort(int *A, int *B....
分类:其他好文   时间:2014-05-21 18:07:55    阅读次数:294
算法——动态规划篇——最长公共子序列
问题描述      最长公共子序列,英文缩写为LCS(Longest Common Subsequence)。其定义是,一个序列 S ,如果分别是两个或多个已知序列的子序列,且是所有符合此条件序列中最长的,则 S 称为已知序列的最长公共子序列。       解决最长公共子序列,一种常用的办法,就是穷举法,组合出所有的情况,但是这样对于长序列的情况来说,是非常不实际。。 假设现在有...
分类:其他好文   时间:2014-05-21 13:55:35    阅读次数:260
排序算法汇总总结_Java实现
一、插入排序直接插入排序(InsertionSort)的算法描述是一种简单直观的排序算法。它的工作原理是通过构建有序序列,对于未排序数据,在已排序序列中从后向前扫描,找到相应位置并插入。插入排序在实现上,通常采用in-place排序(即只需用到O(1)的额外空间的排序),因而在从后..
分类:编程语言   时间:2014-05-21 12:47:23    阅读次数:503
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