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搜索关键字:dna    ( 1245个结果
一种隐蔽性较高的Java ConcurrentModificationException异常场景
在使用Iterator遍历容器类的过程中,如果对容器的内容进行增加和删除,就会出现ConcurrentModificationException异常。该异常的分析和解决方案详见博文《Java ConcurrentModificationException 异常分析与解决方案》和《解决ArrayLis ...
分类:编程语言   时间:2018-02-23 23:54:54    阅读次数:235
poj3080 Blue Jeans(暴枚+kmp)
Description The Genographic Project is a research partnership between IBM and The National Geographic Society that is analyzing DNA from hundreds of t ...
分类:其他好文   时间:2018-02-23 14:47:56    阅读次数:197
[BZOJ4892][TJOI2017]DNA(后缀数组)
题目描述 加里敦大学的生物研究所,发现了决定人喜不喜欢吃藕的基因序列S,有这个序列的碱基序列就会表现出喜欢吃藕的性状,但是研究人员发现对碱基序列S,任意修改其中不超过3个碱基,依然能够表现出吃藕的性状。现在研究人员想知道这个基因在DNA链S0上的位置。所以你需要统计在一个表现出吃藕性状的人的DNA序 ...
分类:编程语言   时间:2018-02-21 23:03:07    阅读次数:277
bzoj千题计划241:bzoj3864: Hero meet devil
http://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=3864 题意: 给你一个DNA序列,求有多少个长度为m的DNA序列和给定序列的LCS为0,1,2.... 求LCS方式:f[i][j]=max(f[i-1][j],f[i][j-1],f[i-1][j- ...
分类:其他好文   时间:2018-02-20 11:18:13    阅读次数:172
Python3 模块
在脚本上如果是用python解释器来编程,如果你从Python解释器退出再进入,那么你定义的所有的方法和变量就都消失了。 为此 Python 提供了一个办法,把这些定义存放在文件中,为一些脚本或者交互式的解释器实例使用,这个文件被称为模块。 模块是一个包含所有你定义的函数和变量的文件,其后缀名是.p ...
分类:编程语言   时间:2018-02-20 10:33:08    阅读次数:150
【紫书】例题3-6 环状序列(Circular Sequence, ACM/ICPC Seoul 2004, UVa1584)
【题目描述】 长度为n的环状串有n种表示法,分别为某个位置开始顺时针得到。例如,图中的环状串有10种表示: CGAGTCAGCT,GAGTCAGCTC,AGTCAGCTCG等。在这些表示法中,字典序最小的称为“最小表示”。 输入一个长度为n(n<=100)的环状DNA串(只包含A、C、G、T这4种字 ...
分类:其他好文   时间:2018-02-16 17:38:29    阅读次数:192
Python模块-logging模块(一)
logging模块用来写日志文件 有5个级别,debug(),info(),warning(),error()和critical(),级别最高的为critical() debug()为调试模式,info()为正常情况下的信息,warning()为警告,error()为错误,critical()为严重 ...
分类:编程语言   时间:2018-02-15 20:15:29    阅读次数:256
DNA Consensus String,( UVa, 1368 )
题目链接 :https://vjudge.net/problem/UVA-1368 题目首先得知道什么是Hamming距离(自行查找),然后注意出现多个解是选择字典序小者(直接将字典序排号比较),**注意数组大小。 ...
分类:其他好文   时间:2018-02-14 12:56:05    阅读次数:161
LCS(最长公共子序列)
这个问题很有意思,在生物应用中,经常需要比较两个(或多个)不同生物体的DNA片段。例如,某种生物的DNA可能为S1 = ACCGGTCGAGTGCGCGGAAGCCGGCCGAA,S2 = GTCGTTCGGAATGCCGTTGCTCTGTAAA。比较两个DNA串是想要确定它们之间的“相识度”,作为 ...
分类:其他好文   时间:2018-02-13 20:32:43    阅读次数:172
Biopython 模块处理Seq序列 方法
Biopython 模块1.序列 赋值 Bio.Alphabet.IUPAC 提供蛋白质、DNA和RNA的基本定义,并提供扩展和定制基本定义的功能。1.1 DNA 字母表 基本字母:IUPACUnambiguousDNA每种可能下的歧义字母:IUPACAmbiguousDNA修饰后的碱基:Exten ...
分类:编程语言   时间:2018-02-12 00:21:09    阅读次数:846
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