samtools 之前博文已经介绍过一些常用的方法。本篇主要说下如何利用samtools 和
bcftools来call snp。和其他工具一样,bam文件都要经过处理(另见博文)。假如对C17样本进行call snp,
数据为:LC17-1_L002.sorted.rmp.rg.recal.bam...
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2014-06-02 07:29:20
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每一个应用程序都有一个通知中心,NSNotificationCenter,专门负责协助不同对象之间的消息通信任何一个对象都可以向通知中心发布通知NSNotification,描述自己在做什么。其他感兴趣的对象(Observer)可以申请在某个特定通知发布时(或在某个特定的对象发布通知时)收到这个通知...
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2014-06-02 07:24:48
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所有的设计模式都是对不同的可变性的封装,从而使系统在不同角度达到“开闭原则”的要求。
在软件软件系统中,一个模块设计得好不好的最主要、最重要的标志,就是该模块在多大程度上将自己的内部数据和其他与实现有关的细节隐藏起来。一个设计得好的模块可以将它所有的实现细节隐藏起来,彻底地将提供给外界...
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编程语言 时间:
2014-06-02 07:17:08
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??pch头文件的内容能被项目中的其他所有源文件共享和访问??一般在pch文件中定义一些全局的宏??在pch文件中添加下列预处理指令,然后在项目中使用Log(…)来输出日志信息,就可以在发布应用的时候,一次性将NSLog语句移除(在调试模式下,才有定义DEBUG)#ifdef
DEBUG#defin...
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2014-06-02 07:12:35
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?建立一个工程后,会在Supporting
files文件夹下看到一个“工程名-Info.plist”的文件,该文件对工程做一些运行期的配置,非常重要,不能删除?在旧版本Xcode创建的工程中,这个配置文件的名字就叫“Info.plist”?项目中其他Plist文件不能带有“Info”这个字眼,不然...
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2014-06-02 06:41:17
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我觉得,一个人一直都在学习的东西就两样:选择和放弃。这个,在《谁的大学不迷茫》的一书中也提到了。
有的选择不是在我们的意愿之下做的,而是迫于当时”情况需要“,而并没有经过自己的大脑认真的思考,就匆匆忙忙的把自己投入到另外一个领域,而完全抛弃此刻之前已经熟悉的技术或者其他方面的。...
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2014-06-02 04:52:08
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Google的应用系统提供了很多的应用,比如 Google广告,Google 任务,Google 日历,Google blogger,Google Plus,Google 地图等等非常的多的应用,请见下图,
只是google API的冰山一角。有的时候,我们需要把这些系统的数据集成到我们自己的系统当中(自己开发的Web系统,或者其他的系统当中)。这个时候,我们就不得不了解如何使用Google APIs来帮助我们进行不同系统之间的集成。...
宿主机(windows)和客户机(虚拟机)网络连接
推荐使用第一种。
1.host-only(仅主机模式):宿主机与客户机单独组网(用的是网络连接中的VMnet1,所以宿主机的vm1要开启)
好处:和真实网络隔离
坏处:虚拟机与其他服务器之间不能通信
可以设置虚拟机成静态ip,这样ip就永远不会变了,网关要用vm1的ip地址;vm1的ip也是静态的不会变;我做编程虚拟机不上网用这个很实用,ip永远不会变,连虚拟机方便,我通常是将不常用的大软件安装到虚拟机,外部通过ip访问,如oracle、m...
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2014-06-02 02:59:25
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概述
Hibernate 提供了以下几种检索对象的方式
导航对象图检索方式: 根据已经加载的对象导航到其他对象
OID 检索方式: 按照对象的 OID 来检索对象HQL 检索方式: 使用面向对象的 HQL 查询语言QBC 检索方式: 使用 QBC(Query By Criteria) API 来检索对象. 这种 API 封装了基于字符串形式的查询语句, 提供了更加面向对象的查...
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2014-06-02 02:34:18
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有时候我们会遇到window进程间共享数据的需求,比方说我想知道系统当前有多少某个进程的实例。我们可以在程序中定义一个全局变量,初始化为0,每当程序启动后就加1,当然我们我们可以借助第三方介质来储存这个变量,然后解析。这样做必须做到先写入后解析,不能实时更新数据。如果不考虑其他储存介质,只是进程中的通信,应该怎么做呢?windows提供了一些可行的方法,下面介绍常用的两种。
一、共享数据段
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