码迷,mamicode.com
首页 > 编程语言 > 详细

R语言与医学统计图形-【17】ggplot2几何对象之热图

时间:2020-02-14 16:43:12      阅读:96      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:-o   hit   http   r语言   对象   alt   ggplot2   shu   column   

ggplot2绘图系统——heatmap、geom_rect

这里不介绍更常见的pheatmap包。

1.heatmap函数

基础包。

data=as.matrix(mtcars)
#接受矩阵
heatmap(data)
heatmap(data,scale = 'column')

技术图片

heatmap(data,scale = 'column',
        col=terrain.colors(256),
        Colv = NA,
        Rowv = NA)

技术图片

2.geom_tile

ggplot2
中,热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect(矩形)或tile(瓦片),两者效果相同。

mydata <- data.frame(year=2000:2015,lung=runif(16),
                     liver=runif(16),bone=runif(16),
                     luk=runif(16),eso=runif(16),gas=runif(16),
                     eye=runif(16),brain=runif(16),pan=runif(16),
                     kidney=runif(16),breast=runif(16))
mydata2 <- reshape(mydata,varying = list(names(mydata)[-1]),
                   timevar = 'cancer',direction = 'long',
                   times = names(mydata)[-1])
ggplot(mydata2,aes(x=year,y=cancer))+
  geom_tile(aes(fill=lung))+ #瓦片图
  coord_polar(theta = 'y',start = 0.25)+ #极坐标转换
  scale_fill_gradient(low = 'white',high = 'red')+
  guides(fill=guide_colorbar(title = '肿瘤发病率'))

技术图片

R语言与医学统计图形-【17】ggplot2几何对象之热图

标签:-o   hit   http   r语言   对象   alt   ggplot2   shu   column   

原文地址:https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12307754.html

(0)
(0)
   
举报
评论 一句话评论(0
登录后才能评论!
© 2014 mamicode.com 版权所有  联系我们:gaon5@hotmail.com
迷上了代码!