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利用 pacbio 数据组装真菌基因组
最近在做组装稻瘟病的基因组。 估计的基因组大小为40M。 由于没有参考基因组,进行de novo assembly。 用HGAP策略。需要的有用的pacbio数据量应为400M左右, 选用的seed read 最小长度为6K, seed的覆盖度应在20倍左右。拼接流程为:1,filtering. 2...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 10:59:10    阅读次数:424
在centos上安装skyeye
中间遇到的问题:1,make的时候,提示gui/x.cc:42:22: error: X11/Xlib.h: No such file or direct解决:yum install libX11-devel2, error: X11/xpm.h: No such file or directory...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:06:23    阅读次数:384
Entity Framework查询注意
首先我们看下where的方法,直接查看定义(定义如下),其实一种是对IEnumerable的扩展,一种是对IQueryable的扩展,直接看最常用的,其实区别就在IEnumerable的扩展的参数是系统定义的委托FuncIQueryable的参数则是表达式Expression>,1。IEnume.....
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:05:23    阅读次数:214
单例模式的使用
package com.voice.mongodb;import java.net.UnknownHostException;import com.mongodb.DB;import com.mongodb.DBCollection;import com.mongodb.Mongo;import c...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:03:17    阅读次数:190
ACM 极好的书 我认为是这样的
搜索 图论 贪心 动规 ——《挑战程序设计竞赛》《数据结构》黑书二选一数论 ——《编程珠玑》 《组合数学》开拓思维的好书 《编程之美》 还有网上的趣味数学题《编程珠玑(续)》计算几何的书还没找呢。其他的就是刷oj吧。这些书 像我这么懒的人 到何时能读完呢? Any day now。不管是c/c++方...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:08:26    阅读次数:151
转载 一位程序员的妻子讲述她老公教给她了什么
我曾经跟朋友开玩笑说,这个时代,有两种人的妻子应该要受人尊敬,第一种是军嫂,这是毫无争议的,第二种就是像我这样的,程序员的老婆。当然,这个 玩笑半分自嘲半分真。我的本科是穿着大白褂在各种挂着植物、动物、有机化学、无机化学的门牌的实验室里度过的,在显微镜下给三段生的夹竹桃画过横切片图, 在大头针和解剖...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:07:26    阅读次数:207
LeetCode ---- Merge Sorted Array
题目链接Problem discriptionGiven two sorted integer arrays A and B, merge B into A as one sorted array.Note:You may assume that A has enough space (size t...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:12:36    阅读次数:192
20天自制操作系统(三)
我们看\projects\03_day\harib00j中的文件ipl10.nas: 相当于一个boot源文件,它使用int 0x13 ah=0x2加载某些扇区的文件(loader+kernel)到内存0x从c200中asmhead.nas:相当于一个loader源文件,作用是1.设置VGA为320...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:10:32    阅读次数:174
iMac 查看隐藏文件
在终端输入:显示Mac隐藏文件的命令:defaults write com.apple.finder AppleShowAllFiles -bool true隐藏Mac隐藏文件的命令:defaults write com.apple.finder AppleShowAllFiles -bool fa...
分类:其他好文   时间:2014-06-16 11:13:39    阅读次数:153
JDK中的Timer和TimerTask详解
目录结构:Timer和TimerTask一个Timer调度的例子如何终止Timer线程关于cancle方式终止线程反复执行一个任务schedule VS.scheduleAtFixedRate一些注意点1. Timer和TimerTask Timer是jdk中提供的一个定时器工具,使用的时候会在主....
分类:其他好文   时间:2014-06-19 13:11:57    阅读次数:397
TOJ--1278--最小生成树
今天中午做的 第一次用邻接表去实现...我就写了下prim的 相比于kruskal 还是更喜欢它多一点...虽然知道prim+heap优化 可是我写不来.....对于 heap 虽然觉得它的概念很简单 但实现起来真的好伤啊..我想 对于prim的理解应该差不多了 基本上可以直接手码出来了 虽然这个很...
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:04:05    阅读次数:369
【麦当劳肯德基】是美国在中国的基因武器试验场
有些时候,一提肯德基,我真的控制不住自己的情绪.在这里,我只是以一种十分客观的态度把肯德基的一些内幕告诉大家,只希望每个中国人... 能真正认识肯得基.我慢慢说我的经历吧. 本人是个在外漂泊的大学生,说来惭愧,在外也认识了不少朋友.我的一个朋友的父亲是中国银行某市的一个高层领导,他和美国的肯德...
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:06:50    阅读次数:344
ansys 常见命令集合
APDL换行与续行-APDL规定每行72个字符如果要写表达式A=C1+C2 (C1与C2都为表达式可以用B=C1A=B+C2将一行拆成两行来做但是如果不是表达式,而是输入一个命令参数过多的话,可以用续行命令RMORE,格式如下:RMORE, R7, R8, R9, R10, R11, R12这个命令...
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:05:23    阅读次数:567
二叉堆(binary heap)
堆(heap) 亦被称为:优先队列(priority queue),是计算机科学中一类特殊的数据结构的统称。堆通常是一个可以被看做一棵树的数组对象。在队列中,调度程序反复提取队列中第一个作业并运行,因而实际情况中某些时间较短的任务将等待很长时间才能结束,或者某些不短小,但具有重要性的作业,同样应当....
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:08:10    阅读次数:465
6月11号=》121页-125页
6.1 样式单概述 W3C已经给出了两种样式单语言的推荐标准,一种是级联样式单CSS(Cascading Style Sheets), 另一种是可扩展样式单语言XSL(eXtensible Stylesheet Language)。 6.1.1 CSS CSS主要提供如下两个功能...
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:09:26    阅读次数:385
示例-行颜色间隔显示并高亮
姓名 年龄 地址 zero 0 wuhan one 23 ...
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:12:17    阅读次数:364
在服务器上处理请求时出现未知错误。服务器返回的状态码为500
操作方法:为页面的ScriptManager控件添加EnablePartialRendering="false"的属性 此方法不是直接解决或规避问题的,是为了将详细的页面错误显示出来,以便找到需要修正的地方,个人觉得这才是正道嘛,不能躲避错误,而应尽量不让错误发生。 ---》 找出错误 -- 》 修...
分类:其他好文   时间:2014-06-12 06:14:52    阅读次数:617
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