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JAligner的一个坑

时间:2016-12-14 21:36:18      阅读:142      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:相对   maven   .com   png   工具   idt   多个   文本格式   问题   

JAligner是一个集成多个罚分矩阵的蛋白质序列比对工具包,提供充足的API供开发人员调用。

 

但是,不可否认的是,它的结构写得不够规范。以前我是将它放在普通的Java项目里使用,没有问题。但是,今天,放在Maven目录里却出现问题,起初还以为是我的多线程或者是Hadoop部分出错,debug后却发现JAligner中的罚分矩阵与java类文件混在一起,并且它的程序通过相对路径的方式调用文本格式存储的罚分矩阵。

 

如下图这样:

技术分享

 

显然,在Maven的结构里就会出现问题,Maven只会编译.java结尾的标准类文件,矩阵文件被忽略。

到此,将矩阵文件放到Maven的resource目录即问题解决。

 

此例说明,代码要规范啊。。。

 

JAligner的一个坑

标签:相对   maven   .com   png   工具   idt   多个   文本格式   问题   

原文地址:http://www.cnblogs.com/shixiangwan/p/6180764.html

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