外交部  国防部  发展改革委  教育部  科技部  工业和信息化部  国家民委  公安部  安全部  监察部  民政部  司法部  财政部 人力资源社会保障部  国土资源部  环境保护部 

住房城乡建设部  交通运输部  水利部  农业部  商务部  文化部  审计署  卫生计生委 

人民银行 

(监察部与中共中央纪律检查委员会机关合署办公，机构列入国务院序列，编制列入中共中央直属机构。教育部对外保留国家语言文字工作委员会牌子。
工业和信息化部对外保留国家航天局、国家原子能机构牌子。环境保护部对外保留国家核安全局牌子。)

国资委

海关总署  税务总局  工商总局  质检总局  新闻出版广电总局  体育总局  安全监管总局 

食品药品监管总局  统计局  林业局  知识产权局  旅游局  宗教局  参事室  国管局 

(国家预防腐败局列入国务院直属机构序列，在监察部加挂牌子。国家新闻出版广电总局加挂国家版权局牌子。)

侨办  港澳办  法制办  国研室

(国务院台湾事务办公室与中共中央台湾工作办公室、国务院新闻办公室与中共中央对外宣传办公室、国务院防范和处理邪教问题办公室与中央防范和处理邪教问题领导小组办公室，一个机构两块牌子，列入中共中央直属机构序列。)

新华社  中科院  社科院  工程院  发展研究中心  行政学院  地震局  气象局  银监会 

证监会  保监会  社保基金会  自然科学基金会

信访局  粮食局  能源局  国防科工局  烟草局  外专局  公务员局  海洋局  测绘地信局 

铁路局  民航局  邮政局  文物局  中医药局  外汇局   煤矿安监局

（国家档案局与中央档案馆、国家保密局与中央保密委员会办公室、国家密码管理局与中央密码工作领导小组办公室，一个机构两块牌子，列入中共中央直属机关的下属机构序列。)