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特征提取(机器学习数据预处理)

时间:2019-09-11 11:31:08      阅读:293      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

标签:osi   执行   int   压缩   区别   特征提取   sum   sci   sort   

特征提取(机器学习数据预处理)

 

特征提取与特征选择都是数据降维的技术,不过二者有着本质上的区别;特征选择能够保持数据的原始特征,最终得到的降维数据其实是原数据集的一个子集;而特征提取会通过数据转换或数据映射得到一个新的特征空间,尽管新的特征空间是在原特征基础上得来的,但是凭借人眼观察可能看不出新数据集与原始数据集之间的关联。

这里介绍2种常见的特征提取技术:

1)主成分分析(PCA)

2)线性判别分析(LDA)

 

1.主成分分析(PCA)

一种无监督的数据压缩,数据提取技术,通常用于提高计算效率,帮助降低”维度灾难“,尤其是当模型不适于正则化时。

PCA是一种线性转换技术,其目标是在高纬度数据中找到最大方差的方向,并将数据映射到不大于原始数据的新的子空间上。(所谓数据方差最大的方向即数据沿着该方向的分布最分散)

PCA算法的流程:

1)对原始d维数据集做标准化处理;

2)构造样本的协方差矩阵;

3)计算协方差矩阵的特征值和相应的特征向量;

4)选择前k个最大特征值对应的特征向量,其中$k\leq d$;

5)通过前k个特征向量构建映射矩阵W;

6)通过映射矩阵W将d维的原始数据转换为k维的特征子空间。

标准化处理之前的内容有,这里不再赘述;

1.1构造协方差矩阵

公式:

$\sigma_{jk}=\frac{1}{n}\sum_{i=1}^{n}(x_{j}^{(i)}-u_{j})(x_{k}^{(i)}-u_{k})$

n代表数据的总个数,$u_{j}$和$u_{k}$分别代表特征j和k的均值;在标准化后的数据中,样本的均值为0,所以在标准化处理后的数据的协方差又可以表示为:

$\sigma_{jk}=\frac{1}{n}\sum_{i=1}^{n}x_{j}^{(i)}x_{k}^{(i)}$

1.2 协方差特征值与特征向量计算

数学原理不在这里细说,代码实现见下面的小节。

 

1.3 特征值与特征向量的选取

选取那些包含信息最多的的特征向量组成子集,特征值的大小决定了特征向量的重要性,所以选择特征值大小靠前的k个特征值作为选中的特征值,其对应的特征变量作为构建映射矩阵的特征向量。

我们还可以绘制特征值的贡献率:

$\frac{\lambda_{j}}{\sum_{j=1}^{d}\lambda_{j}}$,$\lambda_{j}$表示第j个特征值。

 

1.4 构建映射矩阵W

将选中的k个特征向量构成一个(d,k)维的矩阵W。

 

1.5程序实现

import pandas as pd 
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import StandardScaler

df = pd.DataFrame([    [1,2,3,4,5,6],    [2,4,6,3,3,4],    [3,6,10,4,7,7],    [2,4,7,6,5,4],    [4,7,13,7,3,2],    [1,2,3,3,6,4]    ],columns=["A","B","C","D","E","F"])

#1.标准化
sc = StandardScaler()
sc.fit(df.values)
X_std = sc.transform(df.values)

#2.生成协方差矩阵
cov_mat = np.cov(X_std)

#3.协方差矩阵的特征值与特征向量
eigen_vals,eigen_vecs = np.linalg.eig(cov_mat)

#4.按照重要程度由高往低将特征变量排序
sort_list = np.argsort(eigen_vals)
#取前两个向量组成转换矩阵
w = np.column_stack((eigen_vecs[:,sort_list[0]],eigen_vecs[:,sort_list[1]]))

#5.取第一个数据进行转换
x_1= X_std[0].dot(w)
print(x_1)

结果如下:

技术图片

scikit_learn.decomposition模块中的PCA类也可实现此功能,使用方式如下:

from sklearn.decomposition import PCA
pca = PCA(n_component=2)
X_train_pca = pca(X_train_std)

PCA类中的n_component用于指定需要降到的维数。

 

2.线性判别分析(LDA)

LDA的目标是发现可以最优化分类的特征子空间,是一种监督算法。

LDA的执行步骤是:

1)对d维的原数据集进行标准化处理;

2)对于每一类别,计算d维的均值向量;

3)构造类间的散布矩阵$S_{B}$以及类内的散布矩阵$S_{W}$;

4)计算$S_{W}^{-1}S_{B}$的特征值及对应的特征向量;

5)选取前k个特征值所对应的特征向量,构造一个$d\timesk$维的转换矩阵W,其中特征向量以列的形式排列;

6)使用转换矩阵W将样本映射到新的特征子空间上。

大致上与PCA很相似,这里只介绍与PCA中不同的部分。

2.1计算类内散布矩阵$S_{W}$

 首先计算均值向量$m_{i}$,$m_{i}$储存了类别i中样本的特征均值$u_{m}$,$m_{i}$不是一个值,而是一个向量,包含了每一个特征的均值。

$m_{i}=\frac{1}{n_{i}}\sum_{x\in  D_{i}}^{c}x_{m}$;

 

import pandas as pd 
import numpy as np

df = pd.DataFrame([    [1,2,3,4,5,"ONE"],    [2,4,6,3,3,"TWO"],    [2,4,7,6,5,"ONE"],    [4,7,13,7,3,"TWO"],    ],columns=["A","B","C","D","E","class_label"])


#类别列表
label_list = np.unique(df["class_label"].values)

mean_by_label = {}

#通过类别的数值作为key保存该类别对应的数据的均值
for label in label_list:
    mean_by_label[label] = np.mean(df[df["class_label"]==label].values[:,:-1],axis=0)

for key,value in mean_by_label.items():
    print(key,value)

结果如下:

技术图片

 

每个类别i的散布矩阵$S_{i}$的表达式,Ni表示类别i内的样本数量,这个和协方差的表达式是相同的。

$S_{i}=\frac{1}{N_i}\sum_{x\in D_{i}}^{c}(x-m_{i})(x-m_{i})^{T}N_i$

最终的类内散布矩阵$S_{W}$是由各个类别的散布矩阵累加得来的:

$S_{W}=\sum_{i=1}^{c}S_{i}$

 

 

2.2计算类间散布矩阵$S_{B}$

$S_{B}=\sum_{i=1}^{c}N_{i}(m_{i}-m)(m_{i}-m)^{T}$

其中c代表类别总数量,Ni表示类别i的样本数量,mi是类别i的均值,m是所有数据的均值

 

2.3LDA转换矩阵

PCA是对协方差举证求特征值和特征向量,而LDA是对$S_{W}^{-1}S_{B}$矩阵求解广义特征值和特征向量,剩下的与PCA相同。

 

同样scikit-learn库中也实现了LDA类

from sklearn.lda import LDA
lda = LDA(n_componets=2)

 

特征提取(机器学习数据预处理)

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原文地址:https://www.cnblogs.com/sienbo/p/11432505.html

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