数据库又出问题了？教你给MySQL做全身体检

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数据库是个比较大的话题，有各种各样数据库常见的关系型数据库如Mysql 、oracle、非关系型数据库，还有图数据库等。数据库性能会跟许多部分有关联，从硬件底层存储设备、操作系统、数据库配置参数、数据库架构、数据库表结构、应用层面的连接池设置、以及SQL索引等。

数据库架构

对Mysql数据库进行分析，首先需要了解MySql的系统架构，如下图所示：

从这个架构图，来看Mysql系统架构分为应用层、MySql服务层、存储引擎层。

1. 应用层，应用层是MySQL体系架构的最上层，它和其他client-server架构一样，主要包含：连接处理、用户鉴权、安全管理

2. MySQL服务层：该层是MysqlServer的核心层，提供了Mysql Server 数据库所有逻辑功能

3. 存储引擎层

存储引擎是MySQL中具体与文件打交道的子系统，也是MySQL最有特色的地方。MySQL区别于其他数据库的最重要特点是其插件式的表存储引擎。他根据MySQL AB公司提供的文件访问层抽象接口来定制一种文件访问的机制（该机制叫存储引擎）。

物理文件包括：redolog、undolog、binlog、errorlog、querylog、slowlog、data、index等

SQL运行过程

知道数据库架构后，在性能分析时候需要知道这些模块的功能及运行逻辑，明白一个具体的sql所需要经历的过程：一个sql首先经过Connection Pool到达系统后，需要先进入Sql interface模块判断这个语句，是什么类型。然后通过Parser 模块进行语法与语义检查，并生成相应的执行计划；接着到Optimizer模块进行优化，判断走什么索引，执行顺序等，然后就到Cache中找数据，如果Caches中找不到数据的话，就得通过文件系统到磁盘中进行寻找。

性能分析基本监控指标

了解了mysql系统架构和mysql执行过程还不够，在进行性能分析时，需要找出mysql的问题所得先了解一些基础知识和相应的监控工具。

首先需要了解的两个Schema 分别是information_schema和performance_schema，information_schema，它们保存了数据库中的所有表、列、索引、权限、配置参数、状态参数等信息。像我们常执行的show processlist;就来自于这个schema 中的 processlist 表。performance_schema提供了数据库运行时的资源消耗情况，它以较低的代价收集信息， 可以提供不少性能数据。

还有在分析mysql是需要知道的两个命令:showglobal variables ;和show global status ;前一个用来查看配置的参数值，后一个用来查询状态值。不过这些命令只是简单的罗列信息，并没有统计分析，接下来我们介绍两个个比较好的监控工具。

全局分析:mysqlreport

show status 输出的报告是用来计算性能瓶颈的参考数据，但是数据只是简单的罗列，不好一下子看出性能问题，而mysqlreport 不像show status简单的罗列数据，而是对这些参考数据加以融合计算，整理成一个个优化参考点，然后就可以根据这个优化参考点的值以及该点的衡量标准，进行对应的调整。

一、linux 环境下mysqlreport安装

1. 步骤一：yum -y install perl-DBD-MySQL 依賴包

2. 步骤二：yum -y install perl-DBI #依賴包

3. 步骤三 ：yum -y install mysqlreport

在linux系统上经过这三步就安装好了这个工具。接下来就可以对数据库运行状况进行分析了。

二、mysqlreport使用

使用比较简单，直接执行：

mysqlreport --user tesla --password xxx@2015 --host 127.0.0.1 --no-mycnf--flush-status --outfile ./result.txt

就可以把数据库整体情况保存到当前目录中。

具体命令参数查看

mysqlreport —help

三、mysqlreport结果分析：

数据库操作报表和查询排序报表

这个表反映数据库使用情况，608每秒操作量有点大，slow 这个参数挺重要，只是因为这里设置的慢查询10s太长了，正常情况下尽量设置在1s左右，这块需要对db 进行配置，把慢查询统计设置的短些。

DMS部分告诉我们这个数据库中各种 SQL 所占的比例，这个例子中，SELECT多，要做 SQL 优化的话，肯定优先考虑SELECT语句，才会起到立竿见影的效果。

1. select and sort 查询和排序报表

这块的报表数据具有极大的参考性，一下就能看出问题的所在，这里的Scan（代表全表扫描）每秒48次执行全表扫描，实在是太多了，需要对语句进行修改，也是我们后面优化的重点内容。

2. InnoDB 缓存池报表

InnoDB 缓存池报表，Innodb Buffer Pool size 定义了Innodb 存储引擎的表数据和索引数据的最大内存缓存大小。这部分对MySQL来说很重要，这里使用已经达到100% 这种情况下就必须要增加Innodb缓存池了。这里的Read hit达到 92.57%，这个值越大越好，尽量达到100% 这里的值与Innodb buffer太小有关。

3. 连接报表

从这里可以看出数据连接还完全够用。

4. 表锁报表

Waited表示有多少次查询需要等待表锁定；Immediate表示有多少次查询可以立即获得表锁定，同时后面还有一个比例

对数据库来说『等待』几乎可以肯定是一件很不好的事情，因此 Waited 的值应该要越小越好。最具有代表性的是第三个字段 (Waited 占所有 table lock 的百分比)这里是0.00%，非常好，没有发送过表锁。

5. 临时表报表

执行explain 在sql分析时出现Using temporary的状态，这意味着查询过程中需要创建临时表来存储中间数据，我们需要通过合理的索引来避免它。另一方面，当临时表在所难免时，也要尽量减少临时表本身的开销，MySQL可以将临时表创建在磁盘（Disk table）、内存（Table）以及临时文件（File）中，显然，在磁盘上创建临时表的开销最大，所以我们希望MySQL尽量不要在磁盘上创建临时表，上面分析结果来看从临时表创建在磁盘(Disktable)和临时文件(File) 上的 量级来说，还是有点偏大了，所以，可以增大tmp_table_size。

其它全局信息可以查下资料

全局分析结果

通过mysqlreport这个工具反应的结果，有以下问题需要去解决下：

1. 总体数据库操作达到600多每秒,对于内网系统用户不太多，操作有点太频繁，看下能够减少不必要的数据库操作。

2. 慢查询未开启，而且设置的时间太长长达10s，通常一个语句大于100ms 可任务需要进行优化，这里需要设置较短分析下慢查询

3. 全表扫描48.5/s 这块要分析下具体的sql写法

4. Innodb 缓存占用使用100% ，而且设置大小太小，需要增加缓存大小。

pt-query-digest 工具

作为分析mysql工具的首选，因为它可以从logs、processlist、和tcpdump来分析MySQL的状况，logs包括slow log、general log、binlog。也可以把分析结果输出到文件中，或则把文件写到表中。分析过程是先对查询语句的条件进行参数化，然后对参数化以后的查询进行分组统计，统计出各查询的执行时间、次数、占比等，可以借助分析结果找出问题进行优化。

安装方法

下载 https://www.percona.com/downloads/percona-toolkit/LATEST/

安装：centos依赖包

yum -y install perl-TermReadKey perl-Time-HiResperl-IO-Socket-SSL.noarch
pt-query-digest --help

pt-query-digest分析 slow /bin log 时产生的报告逻辑非常清晰，并且数据也比较完整。执 行命令后就会生成一个报告,因为线网没开启slow log日志，这里我们分析下线网bin log日志

使用方法

对binlog日志进行转换：

mysqlbinlog --no-defaults -vv --base64-output=DECODE-ROWSmysql-bin.000818 > mysql-bin.000818.txt
pt-query-digest --type=binlog mysql-bin.000818.txt > 818.report.log

筛选出全表扫描语句

设置数据库设置开启 log_queries_not_using_indexes=on；就会输出全表扫描语句到慢查询日志当中。值得注意的是，执行时间超过long_query_time的SQL语句也将记录到slow log中，无论该SQL语句是否使用索引。

profiling的操作步骤：查看详细执行计划

步骤一 ：set profiling=1; //这一步是为了打开profiling功能

步骤二 ：执行语句 //执行你从慢日志中看到的语句

步骤三 ：show profiles; //这一步是为了查找步骤二中执行的语句的ID

步骤四 ：show profile all for query id; //这一步是为了显示出profiling的结果

修改表结构增加索引：索引名一般是表名加字段名

show index fromproject_permissions;
ALTER table project_permissions ADD INDEX idex_project (project_id);
ALTER table tableName ADD INDEX indexName(columnName)
create index 索引名 on 表名（字段名1，字段名2）

分析：执行频率非常高的语句以及全表扫描
1）

explain SELECT project_id, modified_time, name, permissions, isGroupFROM project_permissions WHERE project_id=2076;

根据执行计划和查询条件分析，需要对project_id 建立索引，建立索引后需要注意where条件中值的类型，这里需要把project_id 改成字符串，mysql隐式的将数值类型转换成了字符串类型

2）

explain SELECT id, model_name, model_type, job_id, properties,gmt_create, owner, last_execution_model, gmt_modified, published, status,module_id from mlstudio_model where job_id=13788;

数据库表记录9000条，没有增加索引，可以适当对job_id增加索引，也因为数据较小优先级比较低 ALTER table mlstudio_model ADD INDEX index_model(job_id) 有2倍性能能提升

3）

explain SELECT id, name, user_id, property, gmt_create,gmt_modified, appstatus, execution_info FROM mlstudio_deployed_notebooks WHEREappstatus in (10,140,20,120) ORDER BY gmt_modified desc;

分析及方案：数据库表记录200多条，没有增加索引，会全表扫描，优先级不太高，只不过property字段和execution_info信息数据比较大，建议如果property字段没有用到 查询语句就不指定property

4）

explain select id, algorithm_id, version, create_time, modify_time,module_id, shared, type, source_algorithm_version_id fromti_user_algorithm_version where module_id = 813;

解决方式：数据表记录目前较少 数据库字段比较短

ALTER table ti_user_algorithm_version ADD INDEX index_algorithm(module_id)

5）

explain select id, gmt_create, gmt_modified, name, type,description, checked, permission, user_id, nick_name, config_file_name,config_file_res, module_res, module_dependencies, job_type, user_coded,has_model, icon, module_jars from mlstudio_modules where module_res=0 andtype>0 and type <1001 and job_type=2;

数据记录不多，字段值相对都比较短，查询出来占据空间相对较小 625条影响较小

6）

explain SELECT id, name, type, gmt_create, owner, gmt_modified,published, status, module_id, properties from mlstudio_dataset where module_id= 229;

数据记录不多，字段值相对都比较短，查询出来占据空间相对较小 55条影响较小，对module_id加索引处理，查询很少可以不用处理

7）

explain select algorithm_id from ti_user_algorithm_favorite whereuser_id = ‘jianfehuang’ and algorithm_id = 101;
create index algorithm on ti_user_algorithm_favorite (user_id,algorithm_id);

解决方案 ：创建联合索引，索引后速度有一定提升，只会查出一行记录对缓存占用小。目前数据库记录196条

8）

explain select cid, cname, cdesc, cicon, clevel, cparent, cvisible,group_concat(mid order by mname), sum(mpermission) as public_num from(select mmc.id as cid, mmc.name as cname,mmc.desc as cdesc,mmc.icon ascicon,mmc.level as clevel, mmc.parent_id as cparent,mmc.visible ascvisible,mmc.order_num as corder,mm.id asmid, mm.name as mname,mm.permission as mpermission from mlstudio_module_category mmc left joinmlstudio_modules mm on mmc.id =mm.type) as t group by cid, cname, cdesc, cicon, clevel, cparent, cvisibleorder by corder;

9）

select queuequota0_.id as id1_1_, queuequota0_.cpu as cpu2_1_,queuequota0_.gmt_create as gmt_crea3_1_, queuequota0_.gpu_map as gpu_map4_1_,queuequota0_.jizhi_business_flag as jizhi_bu5_1_, queuequota0_.memory asmemory6_1_, queuequota0_.name as name7_1_, queuequota0_.gmt_modified asgmt_modi8_1_, queuequota0_.uuid as uuid9_1_ from queue_quota queuequota0_ wherequeuequota0_.name=‘g_teg_teslaml_appgroup04’;

分析全表扫描：目前数据表比较小 ，数据量才155条，对性能影响较小，如果预期后面数据量变大，考虑增加索引。

10）

select task0_.id as id1_0_, task0_.admin_group as admin_gr2_0_,task0_.alert_group as alert_gr3_0_, task0_.business_flag as business4_0_,task0_.gmt_create as gmt_crea5_0_, task0_.creator as creator6_0_,task0_.description as descript7_0_, task0_.flag as flag8_0_, task0_.modifier asmodifier9_0_, task0_.name as name10_0_, task0_.project_id as project11_0_,task0_.props as props12_0_, task0_.type as type13_0_, task0_.gmt_modified as gmt_mod14_0_,task0_.view_group as view_gr15_0_ from tj_task task0_ where task0_.project_idin (1157 , 1913 , 2078);

分析全表扫描：目前太极任务数据表比较小 ，数据量才9条，对性能影响较小，如果预期后面数据量变大，考虑增加索引。

慢查询随着某个工程下工作流越多越慢，性能影响很大

select flow_id,max(id * 1000 + status) % 1000 as last_user_drive_status frommlstudio_execution_jobflow where (drive_type = 1 or drive_type is null) andproject_id in (24529) group by flow_id

存在问题扫描大量数据，拷贝到临时表，在执行文件排序。

修改为：

select f.flow_id,f.status from mlstudio_model_flowt inner join mlstudio_execution_jobflow f on t.last_jobflow_id=f.id where t.project_id in (24529)

MySQL调优之innodb_buffer_pool_size大小设置

查询线上配置：

sql> show global variables like ‘innodb_buffer_pool_size’;
sql> show global status like ‘Innodb_buffer_pool_pages_data’;
sql> show global status like ‘Innodb_page_size’;
sql> show global status like ‘Innodb_buffer_pool_pages_total’;

内网查询数据结果：

Innodb_buffer_pool_pages_total | 8191
Innodb_buffer_pool_pages_data | 8116
Innodb_page_size | 16384
innodb_buffer_pool_size | 134217728

调优参考计算方法：

val =Innodb_buffer_pool_pages_data / Innodb_buffer_pool_pages_total * 100%
val > 95% 则考虑增大 innodb_buffer_pool_size， 建议使用物理内存的75%
val < 95% 则考虑减小 innodb_buffer_pool_size， 建议设置为：Innodb_buffer_pool_pages_data * Innodb_page_size * 1.05 / (102410241024)

内网计算出来：8116/8190=99% 需要加大这个数据

数据库配置修改: 测试环境修改的/etc/my.cnf

1、开启慢查询日志，慢查询记录为1秒 ，这个对数据库性能有1%的影响,可以开启一段时间收集一段时间数据后关闭

slow_query_log = ON
long_query_time = 1

2、Innodb缓存增大

innodb_buffer_pool_size = 2G #设置2G

3、临时表目前64M 需要加大

tmp_table_size = 256M;
max_heap_table_size = 256M;

总结

本文简单介绍了数据库优化的相关方法，通过两个工具全局分析:mysqlreport对show status 这些参考数据加以融合计算，整理成一个个优化参考点，然后就可以根据这个优化参考点的值以及该点的衡量标准，进行对应的调整。

pt-query-digest 工具，可以从logs、processlist、和tcpdump 来分析MySQL的状况，logs包括slow log、general log、binlog，可以借助分析结果找出问题进行优化。通过这两个工具可以在数据库配置层，对mysql进行相对比较优化的配置还可以找出性能比较慢的语句，通过profiling 详细分析sql执行的过程进行优化。

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数据库又出问题了？教你给MySQL做全身体检

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